中国民航信息集团公司党委下辖5个直属二级党委、1个直属党总支，共有党员近1400名，构成了基层的90个党支部、1个党总支。其中，有22个支部、近300名党员分布在京外地区。公司2008年进行了集团整体上市，2009年和2011年先后开展了大规模干部调整和补充。在干部调整的基础上，公司对所有的二级党委和一半以上的党支部进行了机构和人员调整，党组织和党务干部队伍得到了更新和壮大。